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單細胞轉錄組 Vs 空間轉錄組,產業 Vs 技術,潮流對撞,雙劍合璧!

2023-12-26  閱讀(335)

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要問現在生物行業最火的創新技術是什么?那非單細胞轉錄組或者空間轉錄組莫屬!

 


各種年度技術評價加持

2009年
 

湯富酬老師發表第一篇單細胞文章,正式拉開單細胞研究的序幕;

2011年
 

nature methods將單細胞列為未來幾年關注技術;

2013年
 

science將單細胞列為年度關注的六大領域;

2014年
 

Nature Methods將單細胞測序為 2013 年度最重要的方法學進展;

2018 年
 

Science 公布的科學突破中,單細胞技術位列突破;

2019 年
 

單細胞多組學技術被 Nature Methods 評為年度技術;

2020 年
 

Nature Methods 年度技術與單細胞轉錄組測序相輔相成的空間轉錄組技術;

2022 年
 

Nature 最新發布,空間多組學技術被評為 2022 年值得關注的 7 項技術之一。

 

圖.單細胞多組學與空間多組學發展進程(圖片來源網絡)

 

除了這些年度技術的高度評價,市場容量、投資價值上也不容小覷。專業咨詢機構Decibio預估全球單細胞分析市場在 2022 年為12億美元(約人名幣60億元),并將以每年 13% 的速度增長,到 2025 年達到約17億美元。這一數字與 10x Genomics 最近的收益一致。睿略行業研究機構預測2022年全球空間基因組學和轉錄組學市場規模達16.41億元(人名幣),中國空間基因組學和轉錄組學市場規模達到2.84億元,預計到2028年,全球空間基因組學和轉錄組學市場規模將達到27.53億元,在預測期間2023-2028內,市場年均復合增長率預估為9.13%。

 

那么,受到如此青睞的技術,到底是做什么的呢?有什么實際的應用價值?

單細胞轉錄組

 
 
 
 

即single cell RNA-seq(scRNA-seq),是指在單細胞水平上對RNA進行高通量測序和分析的新技術。不同于常規組織或細胞群測序(bulk RNA-seq)得到的結果(只是大量細胞平均表達水平),單測序能夠深入挖掘特異性的信息。

空間轉錄組

 
 
 
 

即(St RNA-seq)技術,是指在對細胞的基因表達進行定量測序的同時,提供細胞在組織空間的具體位置信息。與傳統的轉錄組技術相比,空間轉錄組技術能獲得細胞在組織生理環境下真實的基因表達特征,以及與微環境的關系,進一步推進對正常和病理狀態下的細胞特征的理解。

圖.bulk RNA-seq和scRNA-seq以及St RNA-seq的區別(圖片來源于網絡)

 

例如單細胞用于腫瘤預后檢測時,如果只有少數幾個腫瘤細胞的殘留,bulk RNA-seq可能檢測不出,而scRNA-seq能檢出少量腫瘤細胞甚至一個腫瘤細胞的殘留,St RNA-seq不僅能檢出少量腫瘤細胞的殘留,也能指征腫瘤細胞存在的位置信息。

目前單細胞技術及空間轉錄組技術應用范圍非常廣泛,涉及發育生物學、神經生物學、癌癥研究、免疫系統研究、藥物發現與開發、腸道微生物研究等。

 

單細胞技術及空間轉錄組技術的應用

如火如荼的單細胞和空間組學賽道上,也積聚了眾多的廠商。單細胞儀器廠商有進口儀器如10x Genomics、BD Rhapsody,國產儀器商也不少,如華大智造、尋因、達普、墨卓、萬乘、百創、新格元、躍真、德運康瑞等。

 

圖.不同單細胞捕獲平臺儀器廠家匯總

 

空間轉錄組相對于單細胞轉錄組起步較晚,但是目前入駐的企業也不少,不同平臺有不同的技術方法,主要分為探針法和非探針法。

 

圖.不同空間組學技術類型及廠家對比(圖片來源與網絡)

 

除了以上空間組學技術公司外,近期國產廠家也踴躍突破。BGI是家推出單分辨率的空間轉錄組概念(Stereo-seq),之后陸續有其他空間組學技術廠家報道,如百創智造的S系列空間轉錄組-S1000、尋因生物的SeekSpace、德運康瑞的DynaSpatial、躍真生物的M20 Spatial等。

 

鑒于以上,12月19-20日,在北京圍繞單細胞技術及空間技術開展了第四屆單細胞測序技術應用研討會。

 

 

該研討會以“單細胞測序技術應用"和“單細胞&空間組學"為主題,圍繞研究熱點、技術進展、應用場景、臨床需求、市場反饋、瓶頸分析及機遇與挑戰等話題展開了深入探討。

 

翌圣生物科技(上海)股份有限公司曹振博士進行了題為“微流控單細胞技術平臺優質原料的研發"的主題報告。曹老師介紹了單細胞測序技術的發展歷程、高通量單細胞樣本制備和原料開發過程等內容,強調適配微液滴系統的M-MLV突變體篩選——翌圣鎂孚泰生物五大核心酶改造技術,以更短的時間獲得更高的成功率目標突變體。

 

 

翌圣生物科技(上海)股份有限公司創始人&董事長黃衛華與清華大學副研究員高軍濤、Dimension Genomics Inc 聯合創始人、總裁兼執行官曹涵、北京百奧益康醫藥科技有限公司副總經理石菲菲、深圳市真邁生物科技有限公司醫學官王益民和上海歐易生物醫學科技有限公司總經理張志明圍繞主題“單細胞與空間多組學技術前沿與臨床應用"進行了圓桌討論。

 

 

單細胞轉錄組及空間轉錄組在生物創新行業中有著不容置疑的地位,翌圣生物也將不斷在該領域不斷深耕、持續創新。未來,希望能幫助研究人員觀察到生物技術里的生動圖景,讓人類真正掌握生物行業的“神秘密碼"。

 

 

 

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