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翌圣&華大共發布中華家系一號全自動化轉錄組測序數據
自動化建庫
當前，高通量測序已成為生命科學領域最有力的工具，極大促進了腫瘤、遺傳病和病原等領域的發展。高通量測序中的建庫操作仍存在流程繁瑣、人力資源依賴程度高、自動化程度低等問題，限制了其在臨床轉化上的應用。為促進生產轉型和臨床應用，高效穩定的自動化建庫方案是必由之路。
圖1. 轉錄組測序流程（網圖，侵刪）
圖2.中華家系1號全轉錄組RNA標準物質
※測試樣本：中華家系1號RNA標準品（Quartet RNA）D5、 D6 、F7、 M8，且三次平行重復；
※建庫試劑盒：Hieff NGS® Ultima Dual-mode mRNA Library Prep Kit（Cat#12309ES）；
※自動化平臺：MGISP-960自動化平臺；
※測序平臺：DNBSEQ-G99。
圖3.mRNA 建庫試劑盒流程原理圖
MGISP-960自動化建庫與手動建庫文庫濃度
4個中華家系一號RNA標準品D5、D6、F7、M8樣本，每個樣本3次重復，同時采用MGISP-960自動化平臺建庫和手動建庫，自動化建庫與手動建庫均具備高度均一的文庫產量。
圖4.自動化建庫與手動建庫文庫濃度對比
MGISP-960自動化建庫RNA-seq數據與中華家系一號的參考數據集對比
數據質量綜合評分
12309ES測序數據對比到中華家系一號的參考數據集，以分值來代表SNR和RC的綜合水平。
Great！12309ES的數據質量評分高達9.733
數據評價結果
基因counts、表達譜數據質量評價結果：每組樣本包含 3 個技術重復，SNR為31.1，基因表達量結果在技術重復之間具有非常好的可重復性。
圖5.樣本表達譜數據 PCA 分析結果
圖6.基因表達差異倍數與參考數據集一致性分析結果
MGISP-960自動化建庫RNA-seq數據的post alignment分析
表1：post alignment分析的基本QC指標
圖7.rRNA殘留的占比
產品名稱 | 產品貨號 | 產品應用 |
Hieff NGS® Ultima Dual-mode mRNA Library Prep Kit | 12309ES | mRNA建庫 |
Hieff NGS® Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit(Premixed version) | 12310ES | total RNA建庫 |
Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V2 | 12195ES | 酶切法建庫 |
Hieff NGS® DNA Library Prep Kit | 13577ES | 機械法建庫 |
Hieff NGS® DNA selection Beads（Superior Ampure XP alternative） | 12601ES | DNA純化磁珠 |
1×dsDNA HSAssay Kit | 12642ES | 雙鏈DNA（dsDNA）定量 |
翌圣生物攜手華大智造聯合推出翌圣-MGI聯合品牌MGISP-960高通量自動化樣本制備系統。
