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新冠肺炎RT-PCR檢測試劑開發策略

2020-2-27  閱讀(1764)

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從武漢肺炎爆發以來,翊圣生物積極參與其中,基于長期儲備的分子酶雙向改造、蛋白發酵純化和高效抗體篩選技術平臺,翊圣生物已儲備有2000多萬份新型冠狀病毒檢測試劑盒酶原料,可日組裝40萬次新型冠狀病毒核酸檢測試劑盒!現在我們總結武漢肺炎診斷試劑盒(RT-PCR法)中的核心原料的開發策略,供讀者參閱。

一、開發目的:
利用中國CDC和WHO指導文件中相關基因的引物和探針,依次驗證質粒標準品、假病毒標準品,篩選出適合新冠病毒的RNA擴增試劑。
二、開發策略:
1. 模擬測試質粒標準品樣本
將檢測靈敏度和特異性作為RT-PCR探針法檢測試劑的核心指標,篩選出了靈敏度至少達到10 copies (20 μL反應體系),高特異性判別新冠病毒ORF1ab、N gene和E gene的候選配方。

      

  圖1. 以SARS-CoV-2 ORF1ab和N gene質粒為模板,模板投入量107-101拷貝數,采用CDC建議引物和探針,進行單管多重擴增檢測。在此過程中,根據引物和探針屬性,優化擴增程序
                                                                                
  圖2. 以SARS-CoV-2 ORF1ab質粒,E gene PCR產物為模板,模板投入量107-101拷貝數,采用WHO建議引物和探針,進行單管多重擴增檢測。在此過程中,根據引物和探針屬性,優化擴增程序。


2. 模擬測試假病毒標準品樣本
模擬新冠病毒樣本核酸提取到擴增全流程,篩選出了假病毒樣本靈敏度至少達到103 copies/mL (25 μL反應體系)的配方。

                                                                                          

圖3. 以SARS-CoV-2 ORF1ab和N gene假病毒為模板,模板投入量107-103 copies/mL,采用中國CDC建議引物和探針,進行單管多重擴增檢測。


3. 試劑穩定性測試
將試劑保存條件的容忍度和批次穩定性作為試劑穩定性的評估指標,測定該配方批次間和批次內CV值<5%,可反復凍融次數50次,4℃,25℃保存一周,性能無變化,保證了質量穩定可靠。

                                                                    

 圖4. 生產批次:H1029950。以SARS-CoV-2 ORF1ab和N gene假病毒為模板,模板投入量107-103 copies/mL,進行單管多重擴增檢測,比較Ct值和擴增曲線線型。
 

                                                             

圖5. 生產批次:H1029950、H1029920、H1025890。以SARS-CoV-2 ORF1ab和N gene假病毒為模板,模板投入量107-103 copies/mL,進行單管多重擴增檢測,比較Ct值和擴增曲線線型。

                                                                      

圖6. 以SARS-CoV-2 ORF1ab和N gene假病毒為模板,模板投入量106-103 copies/mL,進行單管多重擴增檢測,比較4℃、25℃保存1-7天后Ct值和擴增曲線線型。
 

                                                                              

圖7. 以SARS-CoV-2 ORF1ab和N gene假病毒為模板,模板投入量106-103 copies/mL,進行單管多重擴增檢測,比較反復凍融50次處理后Ct值和擴增曲線線型。

三、RT-PCR檢測試劑盒:Hifair® V nCov Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit
至此,即開發出基于多重熒光RT-PCR原理,可以以冠狀病毒RNA為模板進行多重定量PCR反應的定量試劑,并作為新型冠狀病毒核酸檢測試劑盒的核心組分,用于試劑盒組裝。

                                                                                             


產品信息

產品名稱貨號規格
Hifair® V nCov Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit13110ES60100 T
Hifair® V nCov Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit13110ES801000 T
Hifair® V nCov Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit13110ES9210000 T


搭配UDGase/dUTP,可預防氣溶膠污染,產品如下:

產品名稱貨號規格
Hifair® V nCov Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit (UDG plus)13111ES60100 T
Hifair® V nCov Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit (UDG plus)13111ES801000 T
Hifair® V nCov Multiplex One Step RT-qPCR Probe Kit (UDG plus)13111ES9210000 T

HB200225

 

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