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上海滬鼎生物科技有限公司>技術文章>什么是凝膠遷移實驗(EMSA)?有何作用?

技術文章

什么是凝膠遷移實驗(EMSA)?有何作用?

閱讀:1965          發布時間:2021-1-20

一、實驗原理
一種研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用的技術,可用于定性和定量分析。這一技術初用于研究DNA結合蛋白,目前已用于研究RNA結合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。

通常將純化的蛋白和細胞粗提液和32P同位素標記的DNA或RNA探針一同保溫,在非變性的聚丙烯凝膠電泳上,分離復合物和非結合的探針。DNA-復合物或RNA-復合物比非結合的探針移動得慢。同位素標記的探針依研究的結合蛋白的不同,可是雙鏈或者是單鏈。當檢測 如轉錄調控因子一類的DNA結合蛋白,可用純化蛋白,部分純化蛋白,或核細胞抽提液。

在檢測RNA結合蛋白時,依據目的RNA結合蛋白的位置,可用純化或部分純化的蛋白,也可用核或胞質細胞抽提液。競爭實驗中采用含蛋白結合序列的DNA或RN 片段和寡核苷酸片段(特異), 和其它非相關的片段(非特異),來確定DNA或RNA結合蛋白的特異性。在競爭的特異和非特異片段的存在下,依據復合物的特點和強度來確定特異結合。

二、凝膠遷移或電泳遷移率實驗(EMSA)可以:

1.研究DNA結合蛋白和其相關的DNA結合序列相互作用;

2.可用于DNA定性和定量分析;

3.用于研究RNA結合蛋白和特定的RNA序列的相互作用。

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