按微生物學質量控制的程度或根據微生物凈化程度分類，可分為五類： 

（1）普通動物（conventional animals）：亦稱一級動物，在微生物學控制上要求zui低的動物，它要求不攜帶人畜共患病和動物烈性傳染病的病原。因價格低，故教學實驗中常用之。 

（2）清潔動物（clean animals）：亦稱二級動物，除普通動物應排除的病原外，不攜帶對動物危害大和對科學研究干擾大的病原。

（3）無特殊病原體動物（specific pathogen free animals）：亦稱三級動物，是指動物體內無特定的微生物和寄生蟲存在，但帶有非特定的微生物和寄生蟲的動物。此類動物應排除一、二級動物所排除的病原外，不攜帶主要潛在感染或條件致病和對科研實驗干擾大的病原。 

（4）無菌動物（germ free animals）：是指在動物體內外的任何部位都檢不出一切生命體的動物。這類動物系在無菌條件下剖宮產出，又飼養在無菌、恒溫、恒濕的條件下，食品飲料等全部無菌。 

（5）悉生動物 （gnotobiotes animals）：是指機體內帶著已知微生物的動物。此種動物原是無菌動物，系人為將微生物叢投給其體內，例如使大腸桿菌定居在無菌小鼠體內，在進行微生物檢查時僅能檢出大腸桿菌。 

依據GB14922-2001《實驗動物微生物學等級及監測》劃分的實驗動物等級，并與寄生蟲學等級對應，將實驗小鼠和大鼠的微生物等級分為清潔級、無特定病原體級（SPF）和無菌級三個級別，普通級的實驗小鼠和大鼠原則上不再使用；豚鼠、地鼠和兔分為普通級、清潔級、SPF級和無菌級四個級別。犬和猴分為普通級和SPF級二個級別。