薄層色譜兼備了柱色譜和紙色譜的優點，一方面適用于少量樣品(幾到幾微克，甚至0.01微克)的分離；另一方面在制作薄層板時，把吸附層加厚加大，將樣品點成一條線，則可分離多達500mg的樣品。因此，又可用來精制樣品，此法特別適用于揮發性較小或較高溫度易發生變化而不能用氣相色譜分析的物質。
薄層色譜是在被洗滌干凈的玻板上均勻的涂一層吸附劑或支持劑，待干燥、活化后將樣品溶液用管口平整的毛細管滴加于離薄層板一端約1cm處的起點線上，晾干或吹干后置薄層板于盛有展開劑的展開槽內，浸入深度為0.5cm。待展開劑前沿離頂端約1cm附近時，將色譜板取出，干燥后噴以顯色劑，或在紫外燈下顯色。
薄層色譜的使用注意事項
1、因為是干板，鋪板時手要平穩，否則容易不均勻。
2、點樣時幾個樣點要在一條直線上，大小要合適(斑點直徑一般不超過2mm)，間距5~6mm。
3、點樣用的毛細管不能交叉使用。
4、因溶液太稀，一次點樣如果不夠需重復點樣，則應待前次點樣的溶劑揮發后方可重點，以防樣點過大，造成拖尾、擴散等現象，影響分離效果。
5、點樣結束待樣點干燥后，方可進行展開。點樣要輕，不可刺破薄層。
6﹑放板時手要平穩，否則走出斜線。
制備薄層板所需的儀器與試劑
燒杯(50mL)、載玻片、玻璃棒、1﹪羧甲基纖維素鈉(CMC)水溶液、硅膠G、去離子水
注意要點:
1)室內溫度,尤其不能太潮濕
2)硅膠和水的比例要合適:2.5-4.5最佳.根據自己點樣的粘稠度調節
3)研磨,均勻,耐心,不要怕花時間
4)活化,注意在活化過程中不要受干擾
5)研磨要細、調和均勻，鋪板要注意避免氣泡、厚薄均勻。
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