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HORIBA海外用戶簡訊|牛津大學開創單細胞水平微生物代謝研究新方法
作者 | Sophie
微生物在生態系統中扮演重要角色。研究微生物的技術手段多樣,卻各有利弊:測序技術、質譜和核磁共振結合技術多用于整體分析,能夠獲取微生物系統發育和宏基因組學特征信息,但掩蓋了微生物群體中的高度多樣性;二代質譜可以分析單個細胞,但對細胞有破壞且費用高昂。相比于以上的方法,基于穩定同位素的拉曼單細胞光譜方法可以實現對單細胞的無損標記。
在此背景下,英國牛津大學工程科學系提出了新設想,即利用拉曼單細胞光譜結合氘同位素標記的方法研究氘化碳源在單細胞中的同化吸收。
英國牛津大學
(圖片轉自網絡)
相比于對C標記,對碳源中的H氘化這種方式,成本低,還能標記復雜底物。實驗利用HORIBA共聚焦拉曼光譜儀獲得單細胞光譜(SCRS),在2070-2300 cm-1譜段發現可區分的C-D振動帶,且C-D帶的強度與碳源氘化的程度成正比。實驗證明了拉曼-氘同位素標記不僅可以指示微生物利用氘化碳源的代謝活動,還可以通過分析光譜揭示不同的代謝途徑。
利用低成本和多功能的氘化底物,拉曼-氘同位素標記在單細胞水平上探索代謝途徑和功能上很有潛力 。
更多研究詳細信息可查閱:Analytical Chemistry,DOI: 10.1021/acs.analchem.7b03461或掃描二維碼查看英文原文;如需了解該研究中的測試方法,請info-sci@horiba.com,我們的應用專家將樂于為您提供解答服務。
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