當發現氣體純度夠，而影響氣相色譜儀譜圖剖析時，除了替換為更高純度的氣體外，還能夠從以下方面來處理：
1、分析目標。
不要在高溫下較容易發生氧化、水解的環境中進行，防止樣品組成部分失真甚至消失而影響氣相色譜儀結果剖析；
2、儀器系統。
裝機前，載氣和輔佐氣管路一定要清洗干凈，而且氣體一定要安裝過濾凈化設備，吸附氣體中殘存的攪擾成分，同時注意過濾凈化設備是否失效，并防止氣路調節閥遭到污染而使調節精度下降，氣路污染影響儀器的靈敏度、危害儀器等；
3、色譜柱。
為了防止雜質影響，可在分析柱前接上一段同類型色譜柱，作為保護柱，一段時間后，替換前端保護柱就能夠，防止剖析柱壽命縮短；或許運轉一段時間后，將剖析柱截掉1m左右，去除功能下降的部分色譜柱。
4、色譜圖。
當發現由于載氣或輔佐氣純度不夠，而影響色譜圖剖析時，可通過溶劑空白樣品，進行空白譜圖扣除。
5、檢測器。
氣相色譜儀運轉一段時間后，進行對檢測器的老化，必要的時候，需求進行拆洗，能夠去除由于載氣和輔佐氣不純而殘存在檢測器里的攪擾雜質。
