手持式X熒光光譜儀是通過X內部高壓發生器產生X射線激發被測物體表面電子，電子在躍遷時發生能量釋放從而獲得各種元素的特征譜線。盡管X射線的劑量非常小，但出于對人體健康的考慮，仍然需要在操作和保管時加以注意。
·孕婦使用時應該注意：錯誤操作與使用會導致輻射暴露。
·操作人員對設備安全要負責。使用時，設備應該始終由操作人員負責。
·設備需由受過專業指導與培訓的專業人員來操作。
·不使用時應放到安全地方存放。
·測量時，不要將手部接近設備頭部
·當檢測窗口被物體覆蓋時，紅外近距離傳感器燈亮。如果傳感器未檢測到物體時，不會產生出X射線。
對人體傷害可以參照關于X射線設備儀器的輻射安全標準在我國國家標準GB 15208。
GB 15208：1-2005《微劑量X射線安全檢查設備 第1部分：通用技術要求》中，對微劑量X射線安全檢查設備提出的輻射安全指標是：“設備的單次檢查劑量不應大于5μGy；在距設備外表面125px的任意處（包括設備的入口、出口處），X射線泄露劑量率應小于5μGy/h
Gy（戈瑞）：吸收劑量，指人體受到電離輻射后吸收了多少能量。1千克被照射物吸收電離輻射的能量為1J（焦耳）時稱為1Gy。即：1Gy=1J/kg。
Sv（希沃特）：當量劑量，是反映各種射線或粒子被吸收后引起的生物效應強弱的電離輻射量。它不僅與吸收劑量有關，而且與射線種類、能量有關。1SV=1J/kg 1mSV=10-3SV
首先設備本身應帶有射線的屏蔽裝置。比如說防護鉛板和鉛玻璃，其次，管頭有光閘或者防護罩，主要照射面應該是密不透風的。至于漏散的部分，計量相對于要照射面更小，且波長變長。對人體的危害可以認為更小了。x射線是直線不會拐彎。
后是操作手持式X熒光光譜儀時應該注意的事項：
扣動扳機之前請注意X射線穿越方位。
·檢測過程中不要將身體任何部分接近檢測區域，尤其是眼睛和手部。
·不要手拿樣品至檢測窗口進行測量分析，而是要將設備頭部抵住樣品來進行測量。
·紅外近距離傳感器位于設備頭部，目的是防止在沒有被測樣品時X射線散發。
·想要繞過安全電路，就不要損壞紅外傳感器。損壞這個重要安全設置會致使操作人員曝露于射線之下。有時候，被測樣品可能沒有足夠的反射信息來激發紅外傳感器。在這種 情況下,將一塊白紙或其他反光材料放置于樣品與紅外傳感器之間。
·在檢測小且薄的樣品或低密度材料，例如：塑料，木材，紙或陶瓷時，請使用配選件安全遮擋或臺式操作臺。
·操作設備時，如果有需要，可以配備有正規機構認證的劑量計。
如果操作得當，注意操作事項，手持式X熒光光譜儀不會對人體有傷害。
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