聯系電話
上海起發實驗試劑有限公司
中級會員·16年
- 聯系人：
- 楊經理
- 電話：
- 021-50724187 021-50724961
- 手機：
- 15921799099
- 傳真：
- 021-50724961
- 地址：
- 上海浦東川沙鎮川沙路6619號上海起發實驗試劑有限公司
- 個性化：
- www.qfbio.com
- 網址：
- www.qfbio.com
掃一掃訪問手機商鋪
產品名稱: nano tRNAsequencing kit
品牌: immaginabiotech
貨號: NTRSQ-12
規格：12 rxns
適用物種：所有物種
總RNA輸入量：總RNA ≥ 10微克
工作流程時間：2天
產品包含內容：
1、文庫制備試劑盒 —— 包含全套工具，用于制備多重tRNA測序文庫。
2、數據拆分工具 —— 高效穩定的測序數據拆分工具（激活后40天內可用），需安裝Docker并配備NVIDIA GPU（至少8GB顯存）。
操作流程：
1、tRNA分離與文庫制備
使用試劑盒內提供的試劑完成濕實驗操作步驟。
2、樣本混合檢測
最多可將6個樣本混合至同一文庫中，顯著節省時間并降低檢測成本。
3、桌面級測序
直接在實驗臺上使用牛津納米孔技術(Oxford Nanopore Technology)進行測序。
4、數據分析
可選擇自行分析數據，或聯系我們的專業生物信息學團隊為您提供分析服務。
測序數據可通過以下流程分析：
*原始數據質控：FastQC 檢查測序質量。
*tRNA 比對：使用 Bowtie2 或 tRNAscan-SE 比對到參考基因組。
*表達定量：統計各 tRNA 同工型（isoacceptor）的 reads 數。
*修飾位點檢測：通過突變率分析（如 Nanom6A）預測修飾位點。
測試結果
從tRNA豐度檢測到全面分析
Nano-tRNAseq檢測試劑盒結合Immagina生物信息分析流程，可實現tRNA表達量的檢測與分析。（A）散點圖顯示處理組與對照組樣本中tRNA表達量的平均計數；（B）火山圖展示處理組與對照組差異表達的tRNA表達量。
化學修飾位點檢測
化學修飾的鑒定基于對所有tRNA同工受體各位置堿基識別錯誤的檢測（C）。熱圖顯示處理組與對照組相比觀察到的修飾顯著變化：藍色表示處理組樣本可能存在的修飾缺失；紅色表示處理組樣本新增的修飾位點。
應用方向
1、基礎研究：tRNA 在翻譯調控、應激響應中的作用。
2、疾病機制：癌癥、神經退行性疾病中 tRNA 表達異常。
3、微生物組：病原菌 tRNA 修飾與耐藥性關聯。
注意事項
1、避免 RNA 酶污染，全程使用無 RNA 酶槍頭和離心管。
2、接頭需避光保存，反復凍融不超過 3 次。
3、建議設置陽性對照（已知 tRNA 標準品）。
常見問題
Q1：能否檢測 tRNA 修飾？
答：本試劑盒通過去修飾步驟提高測序效率，但修飾位點需結合生物信息學工具（如 Modomics 數據庫）進一步分析。
Q2：適用于其他小 RNA 嗎？
答：僅優化用于 tRNA，不適合 miRNA 或 snoRNA。
注：該中文說明書僅供參考，最終請以官F說明書為準。
如有任何疑問，歡迎聯系咨詢上海起發！
immaginabiotech熱賣產品
| 貨號 | 品名 | 規格 | 品牌 |
| RL001_mod1_12rxn | RiboLace Module 1 （12 rxns） | 1kit/12reactions | immaginabiotech |
| RL00S-04 | active ribosome isolation kit | 1kit/4reactions | immaginabiotech |
| RL00P-12 | RiboLace Pro (12 rxns) | 1kit/12reactions | immaginabiotech |
| LS001-12 | LACEseq - 12 rxns RL001_mod1_12rxn | 1kit/12reactions | immaginabiotech |
| RS0XL-12 | ALL-IN-ONE RiboLacePro (12 rxns) | 1kit/12reactions | immaginabiotech |
| KGE00-12 | PAGExt | 1kit/24reactions | immaginabiotech |
| RS-001s | Riboseq All-in-one set 9T | 1kit | immaginabiotech |
| RL001_mod2 | RiboLace Module 2 Kit | kit | immaginabiotech |
| GF001-12 | NEW! RiboSeq Gel free - 12 rxns | 1kit/12reactions | immaginabiotech |
| IBT0032 | tissue lysis buffer for ribosome profiling (tissue) | 18ml | immaginabiotech |
| MX001-36 | ALL-IN-ONE RiboLace Multiplexing | 36Rxns. | immaginabiotech |
| LS-UDI-002-24 | iUDI Plate LACESeq 24T | 1Kit | immaginabiotech |
