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開機首先開冷卻循環水浴，溫度降到10℃以下再開始處理樣品。
濃縮儀每次開機后必須進行自檢，看自動進樣器、進樣針、注射泵、V1閥、V2閥、激光、真空泵等是否正常。注意選擇進樣盤的類型。自檢后不要左右轉動架子，在儀器運行過程中，操作人員不可接觸或移動樣品盤，防止被進樣針扎傷及影響進樣過程的定位。
環境要求：對于二氯甲烷溶劑，要求室內溫度低于30℃，在儀器運行過程中冷凝循環水系統應保持在恒溫4攝氏度。
儀器開機自檢后，不要碰觸進樣針以及桿，不要按注射泵上的INITIALIZE和SET HOME鍵。
試劑：留意試劑選擇和實際的管線顏色相符合，所以，不要隨意拆卸管路。
做樣前，觀察儀器上的試劑瓶是否有足夠的溶劑，廢液瓶已經倒空。
儀器處理所有樣品都必須經過脫水處理，含水量高的樣品可能會帶來清洗的困難，需要特殊的清洗過程，必須避免有沉淀樣品進行自動濃縮。要求處理樣品要過濾處理，不得有絮狀物或者沉淀物，以免堵塞管路。
重復打開冷卻循環水的時候，需要等待5分鐘的時間。重復打開主機的時候 ，需要等待較為少1分鐘。
編輯樣品表時，系統較為多允許建立97個濃縮方法，方法號為2—98；方法0為停止運行，方法1為清洗方法，方法99則在處理過程中如果要跳過某個樣品瓶。
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