高效液相色譜儀(HPLC)是分析實驗室常用的測試儀器之一，其應用越來越廣泛。此種儀器在使用過程中，難免會出現各種各樣的問題，并將直接影響到所測數據的準確性和儀器的正常工作。操作者如果能了解故障的成因，即可清楚預防和排除這些故障的發生，就可正確地使用儀器并最大限度地發揮儀器的性能。
1.基線漂移偏大
(1)柱溫波動:控制好柱子和流動相的溫度。
(2)流通池被污染或有氣泡:用甲醇或其他強極性溶劑沖洗流通池。
(3)檢測器出現阻塞，高壓造成流通池窗口破裂，產生噪音基線:取出阻塞物或更換管子，更換流通池窗需參考檢測器手冊。
(4)柱平衡慢:特別是流動相發生變化時，用中等強度的溶劑沖洗，提前預約客戶，在分析前用10～20倍體積的新流動相對柱子進行沖洗。
(5)流動相污染、變質或由低純度溶液配成:使用高品質的化學試劑及高效液相色譜(HPLC)級的溶劑。
(6)樣品中有強保留的物質(高K′值)以饅頭峰樣被洗脫出，從而表現出一個逐步升高的基線:使用保護柱，如有必要，在進樣之間或在分析過程中，用強溶劑沖洗柱子。
(7)流動相不均勻、配比不當或流速有變化:在配制流動相時應充分搖勻，同時要根據目標分離物和流動相的極性合理配比，并保持流速恒定。
(8)柱子平衡時間短:HPLC色譜柱根據使用環境不同，平衡時間通常要控制在(30～60)min。
(9)檢測器沒有設定在最大吸收波長處:檢測器沒有設定在最大吸收波長處不僅影響檢測器的靈敏度和結果的準確度，還會使基線漂移加大，應該將檢測器設定在最大吸收波長處。
2.噪聲偏大
(1)在流動相、檢測器或泵中有空氣:流動相脫氣，并沖洗系統以除去檢測器或泵中的空氣。
(2)管路漏液:檢查管路接頭是否松動，泵是否漏液，是否有鹽析出和不正常的噪音。
(3)流動相污染、變質或有低純度溶液配制:使用高品質的化學試劑及HPLC級的溶劑。
(4)溫度差異影響(柱溫過高，檢測器未加熱):減少差異或加上熱交換器。
(5)在同一條線上有其他電子設備:斷開LC、檢測器和記錄儀，檢查干擾是否來自于外部，加以更正。
(6)檢測器/ 記錄儀電子元件的問題:斷開檢測器和記錄儀的電源，檢查并更正。
(7)泵震動:在系統中加入脈沖阻尼器。
(8)檢測器燈能量不足:更換燈。
(9)色譜柱填料流失或阻塞:更換色譜柱。
3.重復性偏大
(1)峰型不佳(如峰拖尾、峰寬較大、分裂峰等都不利于峰面積的計算，造成重復性偏大):可以改變色譜柱條件，改變溫度、流速等參數，以獲得較尖銳的峰型，利于保證積分的準確性。
(2)泵流速不穩:可以根據泵流速檢定情況作出判斷，泵流速的穩定性對峰面積的重復性影響非常大。例如:在其他條件不變的情況下，將流速由1.0mL/min改為0.5mL/min，結果保留時間加倍，峰面積也加倍，也可以看出峰面積在一定條件下基本與流速成反比。
(3)色譜柱影響:色譜柱固定相的流失，以及色譜柱對標樣的吸收等都會影響檢測結果；特殊情況下還會發生柱子對樣品的不可逆吸收，建議使用替代柱。
(4)柱溫有變化:柱溫對保留時間有顯著影響，保留時間的變化直接影響積分面積的大小。因此應保持柱溫恒定。
(5)進樣器漏液:進樣器漏液導致進入色譜柱的樣品量發生變化，進而導致峰面積發生變化，應檢查進樣墊等易損部件以排除漏液。
(6)樣品本身的影響:樣品降解或溶劑揮發都會導致重復性偏大，應確定方法的準確性和采取措施控制揮發。
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