間隙連接（gap junction） 存在于大多數動物組織。在連接處相鄰細胞間有2～4nm的縫隙，而且連接區域比緊密連接大得多，zui大直徑可達0.3μm。在間隙與兩層質膜中有大量蛋白質顆粒，是構成間隙連接的基本單位，稱連接子（connexon），由6個相同或相似的跨膜蛋白亞單位環繞而成，直徑8nm，中心形成一個直徑約1.5nm的孔道。通過向細胞內注射分子量不同的染料，證明間隙連接的通道可以允許分子量小于1.5KD的分子通過。這表明細胞內的小分子，如無機鹽離子、糖、氨基酸、核苷酸和維生素等有可能通過間隙連接的孔隙。

間隙連接的通透性是可調節的。在實驗條件下，降低細胞PH值，或升高鈣離子濃度均可降低間隙連接的通透性。當細胞破損時，大量鈣離子進入，導致間隙連接關閉，以免正常細胞受到傷害。