1. 加熱方式：
氣套式加熱和水套式加熱，兩種加熱系統都是和可靠的，同時它們都有著各自的優點和缺點。水套式加熱是通過一個獨立的水套層包圍內部的箱體來維持溫度恒定的，其優點：水是一種很好的絕熱物質，當遇到斷電的時候，水套式系統就可以比較長時間的保持培養箱內的溫度準確性和穩定性（維持溫度恒定的時間是氣套式系統的3－4倍），有利于實驗環境不太穩定（如有用電限制，或者經常停電）的用戶選用。氣套式加熱是通過遍布箱體氣套層內的加熱器直接對內箱體進行加熱的，又叫六面直接加熱。氣套式與水套式相比，具有加熱快，溫度的恢復比水套式培養箱迅速的特點，特別有利于需要箱門頻繁開關的培養。此外，對于使用者來說氣套式設計比水套式更簡單化 （水套式需要對水箱進行加水、清空和清洗，并要監控水箱運作的情況）。
2. 溫度均一性：
培養箱箱體內的溫度均一性也是用戶需要考慮的主要因素，一般在箱體內配備了風扇以及風道的培養箱的均一度要好很多，同時此裝置還有助于箱內溫度和相對濕度的迅速恢復。
3. 溫控系統：
保持培養箱內恒定的溫度是維持細胞健康生長的重要因素，因此可靠的溫控系統是培養箱*的重要部分。用戶選用具備相互獨立三重溫度控制功能的培養箱，即主加熱單元，提供溫控；底部加熱單元，加熱水盤控制濕度；們加熱單元，防止玻璃觀察門產生冷凝水，并幫助們開啟后的溫度恢復，如此保證培養箱穩定的工作。
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