一、原理不同：凱氏方法是測量；燃燒法是相對測量
凱氏方法是利用98%H2SO4消化、堿性環境蒸汽蒸餾、硼酸吸收、指示劑滴定終點顏色判定法，根據滴定體積來計算出氮含量。燃燒法：在高溫情況下，使用充足的氧氣將樣品全部燃燒，生成氮的氧化物，再還原出氮元素，利用TCD 檢測器測量其信號強度，與事先標定的曲線進行比對，計算出樣品中的氮含量。凱氏方法是測量，與標準樣品無關，可以直接測量標準品的含量，并用來檢驗儀器的準確性；燃燒法是相對測量，必須依靠標準品，標準品的準確性定標直接影響測量結果，沒有辦法檢驗儀器的準確性。
二、測量的對象不同：凱氏測量的是氨態氮氮；燃燒法測量的是總氮
樣品中的氮含量根據定義不同有：總氮、凱氏氮、銨態氮、硝態氮、亞硝態氮；也可以分為：有機氮和無機氮。燃燒法測量的是總氮的含量。凱氏方法可以分別測量出來上述各個氮含量。樣品不經過消化直接蒸餾測量，就是無機氮中的銨態氮；在蒸餾過程中加入催化劑將硝態氮、亞硝態氮轉換成銨態氮，其結果就是無機氮。樣品經過消化蒸餾得到的是凱氏氮，在消化前加入催化劑將硝態氮、亞硝態氮轉換成銨態氮，得到的是總氮。因而燃燒法測量的結果總是高于凱氏氮的結果；沒有人為摻假的食品，二者測量結果是一樣的。
三、標準不同：凱氏方法是所有樣品的國標；燃燒法是參考方法
凱氏方法是食品、飼料、土壤、環境、種子等樣品中氮或蛋白質含量測量的強制標準，測量結果具有互通性和可比性。由于燃燒法和凱氏法測量的氮含量對象不同，造成樣品種類不同、成份不一樣，結果偏差也不一樣。燃燒法不適合化肥中的氮含量的國家標準。
四、樣品量不同：凱氏方法是常量分析；燃燒法是微量分析
凱氏方法是常量和半微量；燃燒法是從微量擴展到半微。凱氏法固體到5g、液體到15ml；燃燒法zui多到1g；關鍵是：凱氏法可以一直使用zui大量分析，而燃燒法如一直使用zui大量分析，則燃燒后的無機殘渣堆積在儀器里面，要求頻繁清理，同時也會縮短儀器的使用壽命。對于均勻性不好的固體樣品，脂肪高的食品，只能通過大取樣量來減少測量結果的偏差，燃燒法顯得稍微。困難；如大豆、玉米。此外鮮肉類食品，由于蛋白、脂肪分布不均勻，也建
議是大的取樣量。
五、設備價格：凱氏定氮儀一般是10-40 萬；燃燒法定氮儀一般是50 萬
凱氏方法根據自動化程度不同一般有很多種型號，價格相差也較大。燃燒法型號比較單一，一般帶有100 位的自動進樣器，價格比較昂貴。
六、運行費用：凱氏方法的試劑成本：RMB1.0 元/樣品；燃燒法的耗材成本是：RMB10 元/樣品
凱氏法用到的常規試劑：CUSO4、K2SO4、H2S04、氫氧化鈉、硼酸等，一個樣品的試劑成本為：人民幣0.5元左右。燃燒法的耗材包含樣品舟、還原劑等，一般需使用進口的，才能保證結果的準確性；一個樣品的成本為：人民幣10 元左右。
七、分析速度：凱氏定氮儀要1 個小時；燃燒法定氮儀只需3 分鐘
燃燒法分析一個樣品一般為：3-5 分鐘，非常快；全自動凱氏定氮儀的蒸餾滴定時間一般為3-5 分鐘，但消化時間要1 小時；一個樣品要一個小時以上，對于大量樣品的用戶，要合理配置消化部分：使用20 位的消化器，做到消化、蒸餾滴定同時進行，形成一個連續過程，可以達到：平均5 分鐘一個樣品。
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